Support
Pacific Science
Your shopping cart
ดูตะกร้าสินค้าของคุณ
ไม่มีสินค้าในตะกร้าของคุณ

DNA Sequencing

วันที่: 2017-02-06 10:36:02.0

 

DNA Sequencing Services

  • Incoming sample QC
  • Fluorescent dye-terminator sequencing
  • ABI 3730xl DNA sequencers
  • >650bp Q20 read lengths typical
  • NGS Sequencing now available
  • Template preparation and primer synthesis available
 

ไพร์เมอร์(Primer)

  • มีบริการสำหรับ Universal Primer โดยไม่มีค่าใช้จ่ายเพิ่มเติม สาหรับ Specific Primer ต้องส่ง Primer มาพร้อมกับตัวอย่างหรือสามารถเลือกใช้บริการสั่งสังเคราะห์ Primer กับทางบริษัท
  • Specific Primer ต้องมีความเข้มข้น 10 pmole/μl หรือมากกว่า ในปริมาณ 10 μlถ้าใช้ PrimerเดียวกันทำSequencing Reaction มากกว่า 1 ตัวอย่าง ต้องส่ง Primer เพิ่มที่ความเข้มข้น10 pmole/μlในปริมาณ 2 μl ต่อ 1 Reaction
  • ในกรณีต้องการให้ส่ง Primer ที่สั่งสังเคราะห์กลับ มีค่าใช้จ่ายในการสั่งกลับ
  • ความยาวของ Primer ควรยาวกว่า 15 base แต่ไม่เกิน 50 base
**** ห้ามใช้ Random Primer เป็น Primer สาหรับทำ SequencingและSequencing ควรระบุ annealing temperature

Universal Primer

Universal Primer Name Sequence
3' AOX 5'-GCAAATGGCATTCTGACATCC-3'
BGH-Reverse 5'-TAGAAGGCACAGTCGAGG-3‘
CMV-Forward 5'-CGCAAATGGGCGGTAGGCGTG-3'
EGFP-C 5'-ATGGTCCTGCTGGAGTTC-3'
EGFP-N >5'-CGTCGCCGTCCAGCTCGACCAG-3'
M13 Forward 5'-GTAAAACGACGGCCAGT-3'
M13 Reverse 5'-CAGGAAACAGCTATGAC-3'
pBADForward 5'-ATGCCATAGCATTTTTATCC-3'
pBADReverse 5'-GATTTAATCTGTATCAGG-3'
pFastBacF 5'-GGATTATTCATACCGTCCCA-3'
pFastBacR 5'-CAAATGTGGTATGGCTGATT-3'
pGEX3' 5'-CCGGGAGCTGCATGTGTCAGAGG-3'
Universal Primer Name Sequence
pGEX5' 5'-GGGCTGGCAAGCCACGTTTGGTG-3'
pQEPromotor 5'-CCCGAAAAGTGACACCTG-3'
pQEReverse 5'-GTTCTGAGGTCATTACTGG-3'
pTriplEx3' 5'-ACTCACTATAGGGCGAATTG-3'
pTriplEx5' 5'-CTCGGGAAGCGCGCCATTGTGTTGGT-3'
S-Tag primer 5'-GAACGCCAGCACATGGACA-3'
SP6 5'-ATTTAGGTGACACTATA-3'
T3 5'-ATTAACCCTCACTAAAG-3'
T7 (short) 5'-AATACGACTCACTATAG-3'
T7 (long) 5'-AATACGACTCACTATAGGG-3'
T7 terminator 5'-GCTAGTTATTGCTCAGCGGT-3'
 

การเตรียมตัวอย่าง(Sample Preparation)

  • Unpurified PCR Products : เตรียมความเข้มข้นของตัวอย่าง 30 ng/μl ในปริมาณที่มากกว่า 50μl
  • Purified PCR Products : ใช้ชุดน้ายา PCR product purification Kit ในการ purified PCR Products และตรวจสอบความบริสุทธิ์ด้วยการรัน Agarosegel และส่ง Single DNA bandที่ต้องการใน Deionized distilling water ความเข้มข้นของตัวอย่าง 30 ng/μl ในปริมาณ 15 μl
  • Purified Plasmid DNA : ใช้ชุดน้ายา Plasmid DNA purification Kit และเก็บตัวอย่างที่ต้องการใน Deionized distilling water ความเข้มข้นของตัวอย่าง 100-200 ng/μl ในปริมาณ30-50 μl (ไม่ควรใช้ TE buffer ในการละลาย)

ขั้นตอนการทำ Sequencing เมื่อได้รับตัวอย่าง

  1. ตัวอย่างที่ได้รับจะนำไปรัน Gel electrophoresis ก่อนเพื่อตรวจสอบ หากตัวอย่างไม่ผ่าน QC ทางBiobasicInc. จะปฏิเสธตัวอย่างและไม่เสียค่าใช้จ่าย (กรณีที่ต้องการตัวอย่างคืน ลูกค้าต้องเป็นผู้รับผิดชอบค่าใช้จ่ายในการขนส่งและค่าพิธีการทางศุลกากรเอง)
  2. ตัวอย่างที่ผ่าน QC จะส่งไปยังเครื่อง Automated ตามกระบวนการ Sequencing service และ Automated Sequencer ABI Prism 3730 XL ซึ่งอ่านค่าได้มากกว่า 650 bp(ในกรณีที่อ่านผล sequence ไม่ได้ในครั้งแรกทาง BiobasicInc.จะปรับ condition และทำให้ใหม่อีกครั้ง)
  3. ผลของ Sequencing จะส่งเป็น Chromatogram file และ Word file ทาง E-mail

หลังจากส่งผล Sequencing เรียบร้อยแล้วทาง BioBasic Inc.
จะถือเป็นการจบการบริการ และไม่ทำ Resequence อีก 

ขั้นตอนการรับ-ส่งตัวอย่าง

นัดรับสินค้า - แจ้งวันและเวลาที่สะดวกเพื่อนัดเจ้าหน้าที่เข้าไปรับตัวอย่าง
- กรอกแบบฟอร์ม Sequencing service ส่งพร้อมกับตัวอย่าง
ส่งตัวอย่างทางไปรษณีย์ บริษัท แปซิฟิคไซเอ็นซ์ จำกัด
62,64 ซอยจรัญสนิทวงศ์ 49/1
แขวงบางบำหรุ เขตบางพลัด กรุงเทพฯ 10700